指纹识别技术是最早的通过计算机实现的身份识别手段，它在今天也是应用最为广泛的生物特征识别技术。过去，它主要应用于刑侦系统。近几年来，它逐渐走向市场更为广泛的民用市场。
民用市场也对指纹识别技术提出了更高的要求，这些要求包括：小型化的廉价的指纹采集设备，廉价的高速计算平台，更高的识别准确率，更方便的使用，以及满足各种各样不同应用的能力。
据考古发现，公元前7000-6000年，古代的亚述人和中国人就意识到了指纹的特点，并使用指纹作为个人身份的象征，19世纪中叶开始了对指纹在科学意义上的研究，并产生了两个重要的结论：
1. 没有任何两个手指指纹的纹线形态一致；
2. 指纹纹线的形态终生不变。
这些研究使得一些政府开始使用指纹进行罪犯鉴别，如阿根廷在1896年，苏格兰场在1901年，其他一些国家在二十世纪上叶也纷纷引入指纹技术鉴定罪犯。
用计算机对指纹进行自动识别则起源于二十世纪六十年代，这时候出现了能够处理指纹图像的计算机硬件。从此刑侦用的指纹自动识别系统（AFIS）逐渐在全球开始了广泛的应用。此时的指纹采集一般都采用油墨捺印的方式。
1980年后，随着个人计算机和光学指纹采集器的发明，指纹识别技术开始进入了一些非司法领域，如居民身份证。1990年后，廉价指纹采集器和计算设备的出现，以及快速准确的匹配算法的出现，使得指纹识别技术走向了基于个人的应用。
因此，从历史上看，人们对指纹识别技术有着长期的了解和研究，对指纹的性质也有着深刻的认识。指纹是当之无愧的"物证之首"。
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